[发明专利]一种基于matK基因的未知植物物种识别数据库的构建方法及数据库有效

专利信息
申请号: 202010319607.1 申请日: 2020-04-21
公开(公告)号: CN111681704B 公开(公告)日: 2022-06-17
发明(设计)人: 宁康;白虹;杨朋硕;卢璟详;邹欣桐;李洪军 申请(专利权)人: 华中科技大学鄂州工业技术研究院;华中科技大学
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00;G06K9/62;G16B50/00
代理公司: 北京众达德权知识产权代理有限公司 11570 代理人: 刘杰
地址: 436044 湖北*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 一种基于matk基因的未知植物物种识别数据库的构建方法及数据库,所述方法包括步骤:获取含有matk基因的原始序列数据文件;提取所述原始序列数据文件中的物种注释信息;将所述物种注释信息整合至所述matK基因上,以得到matK序列;对所述matk序列进行质量控制;根据所述matk序列之间的相似性进行聚类;根据聚类结果构建所述数据库。本申请提供的一种基于matk基因的未知植物物种识别数据库的构建方法及数据库优点为:(1)检测通量高;(2)高灵敏度和选择性;(3)该方法所构建的数据库覆盖面广、数据质量高、信息全面;(4)可以利用生物信息学方法在物种的水平上确定未知物种。
搜索关键词: 一种 基于 matk 基因 未知 植物 物种 识别 数据库 构建 方法
【主权项】:
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