[发明专利]一种构建异交物种高密度基因型图谱的方法有效
申请号: | 202010356410.5 | 申请日: | 2020-04-29 |
公开(公告)号: | CN111508560B | 公开(公告)日: | 2023-03-14 |
发明(设计)人: | 黄学辉;杨俊;陈蒙娇;裴东;范维娟;王勤;张鹏;纪飞杨 | 申请(专利权)人: | 上海师范大学 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;G16B20/00 |
代理公司: | 北京律谱知识产权代理有限公司 11457 | 代理人: | 黄云铎 |
地址: | 200233 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了一种构建异交物种高密度基因型图谱的方法,包括:步骤1、对目标植物的亲本材料进行高覆盖测序,对目标植物的子代群体材料进行低覆盖测序,获得相应测序结果;步骤2:将亲子代群体测序获得的序列比对到目标植物的现有基因组上,并得到变异文件,所述变异文件中包含每个被测序材料测得的变异位点信息;步骤3:结合亲本材料的测序结果,对所有亲子代测序比对结果中的单核苷酸多态(SNP)位点进行筛选,将选出的SNP位点进行区段划分,并基于划分后各区段内基因片段的亲缘关系进行基因型分类;步骤4:对划分后的基因型进行单倍体类型统一和缺失基因型填充。 | ||
搜索关键词: | 一种 构建 物种 高密度 基因型 图谱 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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