[发明专利]一种菌群标记物的获取方法、装置、终端及存储介质有效
申请号: | 202010384622.4 | 申请日: | 2020-05-08 |
公开(公告)号: | CN111710364B | 公开(公告)日: | 2022-02-15 |
发明(设计)人: | 蔡云鹏;陈允文 | 申请(专利权)人: | 中国科学院深圳先进技术研究院 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G06K9/62 |
代理公司: | 深圳中一联合知识产权代理有限公司 44414 | 代理人: | 闫冰冰 |
地址: | 518000 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本申请适用于生物技术领域,提供一种菌群标记物的获取方法、装置、终端及存储介质,其中方法包括:获取菌群样本数据,所述菌群样本数据包括N个菌种分类单元在M个菌群样本中的丰度,N及M为正整数;以N个菌种分类单元为叶子节点,以N个菌种分类单元中J个菌种分类单元的共同祖先为中间节点,生成系统发育树;按照由根节点至叶子节点的方向,利用贪心算法对所述系统发育树进行节点搜索,得到至少一个目标节点作为M个菌群样本的菌群标记物。该方案可以降低高维度菌群样本数据的计算复杂度,更高效地实现对目标菌群标记物的确定,减少计算量。 | ||
搜索关键词: | 一种 标记 获取 方法 装置 终端 存储 介质 | ||
【主权项】:
暂无信息
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