[发明专利]一种鉴定水稻稻瘟病菌的引物组及其筛选方法和应用有效

专利信息
申请号: 202010405191.5 申请日: 2020-05-14
公开(公告)号: CN111662997B 公开(公告)日: 2022-02-25
发明(设计)人: 邢俊杰;彭海;邓华凤;彭志荣;石银丰 申请(专利权)人: 湖南杂交水稻研究中心
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11;G16B20/30;G16B25/20
代理公司: 长沙启昊知识产权代理事务所(普通合伙) 43266 代理人: 李儒
地址: 410125*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明涉及一种鉴定水稻稻瘟病菌的引物组及其筛选方法和应用。所述引物组包括正向引物和反向引物,引物组中的多个引物的序列如序列表中SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:200所示。所述引物组的筛选方法,包括:1)将稻瘟病菌的基因组序作为查询序列,并与基因组序列数据库进行比对,将所有基因组序列比对整齐;2)沿着比对整齐的基因组序列做平移;每平移一次对窗口内多个稻瘟病菌的基因组片段进行两两比较,留下有区分度的基因片段作为候选标记位点;3)对每个候选标记位点在多个基因组间的保守区域进行引物设计;4)筛选出引物组。该引物组能够准确且低成本鉴定水稻稻瘟病菌。本发明还包括上述引物组的应用。
搜索关键词: 一种 鉴定 水稻 稻瘟病 引物 及其 筛选 方法 应用
【主权项】:
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