[发明专利]一种用于基因比对的加速方法、装置、存储介质与服务器有效
| 申请号： | 202010442856.X | 申请日： | 2020-05-22 |
| 公开（公告）号： | CN111653318B | 公开（公告）日： | 2023-09-15 |
| 发明（设计）人： | 谭光明;王元戎;张中海 | 申请（专利权）人： | 北京哲源科技有限责任公司 |
| 主分类号： | G16B50/00 | 分类号： | G16B50/00;G16B50/50;G16B30/10 |
| 代理公司： | 北京律诚同业知识产权代理有限公司 11006 | 代理人： | 祁建国 |
| 地址： | 100080 北京市海淀区*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提出一种用于基因比对的加速方法，其特征在于，包括：步骤1，获取待比对的基因序列，并将该基因序列中的各碱基存储于一压缩式BWT数据结构，得到一BWT序列，于该BWT序列中插入一计数点，得到一压缩序列；步骤2，获取一目标碱基，将该压缩序列中的该计数点以表项的形式存储于一查找表中，通过访存该查找表中的该计数点，对该压缩序列中的每一个碱基与所述目标碱基进行比对，得到比对结果；其中，所述压缩式BWT数据结构采用二进制位存储所述基因序列中的各碱基。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 用于 基因 加速 方法 装置 存储 介质 服务器 | ||
【主权项】：
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