[发明专利]一种变异序列的注释方法有效
申请号: | 202010450061.3 | 申请日: | 2020-05-25 |
公开(公告)号: | CN111653313B | 公开(公告)日: | 2022-07-29 |
发明(设计)人: | 文文;王红阳;朱赢;陈淑桢;何慧斯;高勇;汪德鹏 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军海军军医大学第三附属医院;武汉希望组医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;G16B50/10 |
代理公司: | 武汉大楚知识产权代理事务所(普通合伙) 42257 | 代理人: | 徐杨松 |
地址: | 201800 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明属于生物信息技术领域,具体涉及一种变异序列注释方法,所述方法包括:(1)确定变异序列信息:获得变异序列,整合参考序列信息,标准化变异信息;(2)变异注释,注释结果包括注释功能区域、变异类型、核酸序列、氨基酸序列。该方法不仅能实现行业金标准ANNOVAR的现有功能,而且克服了ANNOVAR中的缺点,在区别剪接位点和剪接区域变异、CDS边缘变异、注释frameshift和stoploss/stopgain等方面进行了完善,而且使用了规范的表示方式,还增加了基因编号Entrez ID,具有更好的应用价值。 | ||
搜索关键词: | 一种 变异 序列 注释 方法 | ||
【主权项】:
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