[发明专利]一种基于深度残差神经网络的蛋白质残基接触图预测方法在审

专利信息
申请号: 202010461169.2 申请日: 2020-05-27
公开(公告)号: CN111667880A 公开(公告)日: 2020-09-15
发明(设计)人: 胡俊;樊学强;郑琳琳;白岩松;张贵军 申请(专利权)人: 浙江工业大学
主分类号: G16B15/30 分类号: G16B15/30;G16B50/30;G06N3/04
代理公司: 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 代理人: 王利强
地址: 310014 浙江*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 一种基于深度残差神经网络的蛋白质残基接触图预测方法,首先,输入待进行蛋白质残基接触图预测的蛋白质序列;然后,对蛋白质序列利用20种常见氨基酸的one‑hot表示形式将蛋白质序列转换成一个20×L的矩阵,把蛋白质序列信息数字化,利用20×L的矩阵计算得到20×L×L的协方差张量,即输入网络的特征;其次,搭建深度残差神经网络框架,从PDB库中收集已有蛋白质接触标签的蛋白质序列和标签,计算蛋白质序列的特征张量,与对应的标签组成数据集,使用深度残差神经网络框架在数据集上学习预测模型;最后,将待进行蛋白质残基接触图预测的蛋白质特征张量输入模型,则得到该蛋白质序列残基接触图。本发明计算代价小、预测精度高。
搜索关键词: 一种 基于 深度 神经网络 蛋白质 残基 接触 预测 方法
【主权项】:
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