[发明专利]一种并行多重序列比对方法有效
| 申请号： | 202010552605.7 | 申请日： | 2020-06-17 |
| 公开（公告）号： | CN111916153B | 公开（公告）日： | 2022-06-17 |
| 发明（设计）人： | 邹权;晁健楠 | 申请（专利权）人： | 电子科技大学 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G06K9/62 |
| 代理公司： | 北京正华智诚专利代理事务所(普通合伙) 11870 | 代理人： | 代维凡 |
| 地址： | 611731 四川省成*** | 国省代码： | 四川;51 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种并行多重序列比对方法，该方法包括获取生物学序列数据，K‑mer特征提取，相似度计算，并行聚类分组，构建后缀树，双序列比对，融合比对结果。本发明通过K‑mer特征提取，采用并行聚类算法分组后构建后缀树，并采用Smith‑Waterman算法进行双序列比对，最后融合对比结果，能够较容易的实现多重序列并行化处理，从而快速完成多重序列比对，在序列数量多时相较其它比对方法效率突出，能够适应不同的序列特征，并节省用户大量的时间和精力。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 并行 多重 序列 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
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