[发明专利]一种基于测序数据识别染色质开放区域的方法及装置有效

专利信息
申请号: 202010561435.9 申请日: 2020-06-18
公开(公告)号: CN111724860B 公开(公告)日: 2021-03-16
发明(设计)人: 黄毅;陈柳彬;吴玲清;陈海新;杨玲;易鑫 申请(专利权)人: 深圳吉因加医学检验实验室
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00
代理公司: 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 代理人: 李小焦;郭燕
地址: 518000 广东省深圳市*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 本申请公开了一种基于测序数据识别染色质开放区域的方法及装置。本申请方法包括,测序数据处理步骤,根据cfDNA全基因组测序数据在参考基因组的位置,计算窗口化保护评分和测序深度;初步筛选步骤,定位WPS的波峰和波谷,将相邻波峰的间距大于阈值的区域作为候选染色质开放区域;波峰参数筛选步骤,根据候选染色质开放区域两侧各3‑9个WPS的波峰面积、波峰夹角,波峰间距、波峰高度和波峰宽度进一步筛选;染色质开放区域识别步骤,通过cfDNA平均标准化测序深度验证,准确识别染色质开放区域。本申请方法,无需借助参考图谱,不依赖任何试剂或试验,仅通过数据分析即可简单、有效的获得染色质开放区域,提高了检测质量和效率。
搜索关键词: 一种 基于 序数 识别 染色质 开放 区域 方法 装置
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