[发明专利]基于CMAP势函数的耦合二面角参数优化方法及蛋白质力场在审
| 申请号： | 202010599142.X | 申请日： | 2020-06-28 |
| 公开（公告）号： | CN111755064A | 公开（公告）日： | 2020-10-09 |
| 发明（设计）人： | 康微;蒋帆;吴云东 | 申请（专利权）人： | 北京大学深圳研究生院 |
| 主分类号： | G16B5/00 | 分类号： | G16B5/00;G16B15/20;G16B35/20 |
| 代理公司： | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人： | 张海平;郭燕 |
| 地址： | 518055 广东省*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明涉及分子动力学模拟技术领域，具体涉及蛋白质力场，更具体涉及一种基于CMAP势函数的耦合二面角参数优化方法。该优化方法以现有的蛋白质力场为母力场，以卷曲库中的局部固有构象偏好为拟合目标，对母力场中氨基酸残基的二面角参数进行优化，使得分子动力学模拟获得的局部构象分布与卷曲库中的分布达到预定的相似度。本发明还涉及通过该优化方法获得的蛋白质力场。本发明可以简单而高效地对蛋白质分子中耦合的二面角进行同时优化，二面角参数优化过程简单、高效、可自动化，获得了兼容性强的残基特异性力场RSFF2C，可广泛用于多种MD软件。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 cmap 函数 耦合 二面角 参数 优化 方法 蛋白质 力场 | ||
【主权项】：
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