[发明专利]一种酿酒酵母菌中DNA复制起点的预测方法有效

专利信息
申请号: 202010636957.0 申请日: 2020-07-03
公开(公告)号: CN111755074B 公开(公告)日: 2022-05-17
发明(设计)人: 樊永显;王婉茹 申请(专利权)人: 桂林电子科技大学
主分类号: G16B40/00 分类号: G16B40/00;G16B30/00;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08
代理公司: 桂林市华杰专利商标事务所有限责任公司 45112 代理人: 杨雪梅
地址: 541004 广*** 国省代码: 广西;45
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摘要: 发明公开了一种酿酒酵母菌中DNA复制起点的预测方法,步骤为:获取酿酒酵母菌中的正样本序列和负样本序列;使用二进制编码法和PSEKNC‑I两种方法提取特征;使用F‑score和IFS方法对PSEKNC‑I法得到的特征进行筛选,得到预筛选特征;将二进制编码法得到特征和预筛选特征进行组合,获得特征组合后的样本数据集;构建CNN预测模型并训练,输入数据获得初步预测结果;调整训练后CNN预测模型中参数,对训练后的CNN预测模型进行优化;使用五折交叉验证法对优化后的CNN预测模型进行评估最终得到最优的CNN预测模型,将数据输入最优模型中,得到最终的预测结果。该方法提取多种DNA信息中的特征,减少了计算时间,避免过拟合现象,选出最优的分类模型,提高了预测复制起点预测的准确率。
搜索关键词: 一种 酿酒 酵母菌 dna 复制 起点 预测 方法
【主权项】:
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