[发明专利]一种基于图卷积神经网络的蛋白质自相互作用预测方法在审

专利信息
申请号: 202010638359.7 申请日: 2020-07-06
公开(公告)号: CN111863121A 公开(公告)日: 2020-10-30
发明(设计)人: 王磊;闫欣 申请(专利权)人: 枣庄学院
主分类号: G16B15/30 分类号: G16B15/30;G16B40/00
代理公司: 济南泉城专利商标事务所 37218 代理人: 李桂存
地址: 277132 *** 国省代码: 山东;37
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摘要: 发明提供一种新型的蛋白质自相互作用预测方法,涉及机器学习和生物信息学领域。具体的:通过现有的数据库筛选出蛋白质的序列等信息,并进行预处理;使用位置特异性评分矩阵的构建,将蛋白质信息转化为PSSM矩阵(N*20);再利用深度学习的图卷积神经网络算法,提取去蛋白质的高有效特征信息,极大的降低了数据维度;最后采用随机森林算法,对蛋白质自相互作用进行预测。本发明提供的方法能有效解决单一分类器计算量大,预测结果不准确的问题,将高维数据降维,并提取有效特征信息,同时保证最终预测准确。
搜索关键词: 一种 基于 图卷 神经网络 蛋白质 相互作用 预测 方法
【主权项】:
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