[发明专利]一种适用于禾谷镰刀菌的ChIP-seq方法在审
| 申请号： | 202010676475.8 | 申请日： | 2020-07-14 |
| 公开（公告）号： | CN111850156A | 公开（公告）日： | 2020-10-30 |
| 发明（设计）人： | 李泽卿 | 申请（专利权）人： | 武汉爱基百客生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12Q1/04;G01N33/539;C12R1/77 |
| 代理公司： | 武汉红观专利代理事务所(普通合伙) 42247 | 代理人： | 陈凯 |
| 地址： | 430000 湖北省武汉市东湖新技术*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种适用于禾谷镰刀菌的ChIP‑seq方法，包括对禾谷镰刀菌组织进行甲醛交联反应、细胞裂解获取细胞核沉淀、超声打断染色质获得蛋白核酸复合物的小片段、使用标签抗体与蛋白核酸复合物的小片段进行免疫共沉淀反应、洗脱并纯化与目的蛋白结合的DNA及建库测序六个步骤。本发明主要通过改良优化禾谷镰刀菌组织的染色质提取及超声破碎方法，更高效率获得具有完整天然结构的蛋白，从而得到真实抗体吸附的DNA‑蛋白复合物；且得到的蛋白核酸复合物的小片段可直接用于后续免疫共沉淀反应，得到的DNA检测其浓度并用高通量测序检测全基因组范围内的DNA和目的蛋白的结合情况；并进一步用富集后得到的DNA建库后二代测序，应用于禾谷镰刀菌组织DNA生物信息学分析。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 适用于 禾谷 镰刀 chip seq 方法 | ||
【主权项】：
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