[发明专利]一种基于抗性基因及毒力因子基因评价水体健康风险的方法在审
申请号: | 202010684761.9 | 申请日: | 2020-07-16 |
公开(公告)号: | CN111944914A | 公开(公告)日: | 2020-11-17 |
发明(设计)人: | 柏耀辉;王巧娟;梁金松;廖恺玲俐;曲久辉 | 申请(专利权)人: | 中国科学院生态环境研究中心 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6869;C12Q1/04;G16B20/00;G16B30/10 |
代理公司: | 北京瑞盛铭杰知识产权代理事务所(普通合伙) 11617 | 代理人: | 郭晓迪 |
地址: | 100085*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提供了一种基于抗性基因及毒力因子基因评价水体健康风险的方法,该方法基于宏基因组测序分析,通过对测序数据的组装和分箱,得到微生物基因组草图,从中识别出潜在的耐药性致病菌(PARB),并评价样品中潜在PARB的丰度、多样性和风险等级,对PARB含有ARGs和VFGs的数量及类型进行评估,从而确定环境中潜在的PARB的量及健康风险水平。本发明方法基于宏基因组测序,能够在基因组层面上识别出潜在的PARB,且呈现出较高的可信度,避免了传统纯培养法耗时且易受培养条件影响的限制,能够广泛应用于水体健康风险评价。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 抗性 基因 毒力 因子 评价 水体 健康 风险 方法 | ||
【主权项】:
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