[发明专利]一种基于残基接触图的多目标优化蛋白质结构预测方法在审

专利信息
申请号: 202010704125.8 申请日: 2020-07-21
公开(公告)号: CN112085244A 公开(公告)日: 2020-12-15
发明(设计)人: 张贵军;陈芳;彭春祥;李亭;刘俊;周晓根 申请(专利权)人: 浙江工业大学
主分类号: G06Q10/04 分类号: G06Q10/04;G16B15/00;G16B30/10;G06N3/00
代理公司: 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 代理人: 王利强
地址: 310014 浙江省*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 一种基于残基接触图的多目标优化蛋白质结构预测方法,包括以下步骤:首先利用TripletRes、MetaPSICOV、RaptorX、STOP‑Contact预测目标蛋白质序列的残基接触图;其次,设计打分函数对种群初始化;然后,通过片段重组、组装对种群进行采样;最后,针对不同的预测服务器,根据设计的contact能量函数计算得到四个contact能量,通过调和平均数和标准差的加权打分函数Etotal(Cn)对种群中的所有构象进行排序,选出最后一代中的第一个构象作为预测结果。本发明能够缓解由于单一的残基接触图预测不精确导致蛋白质错误折叠,从而增加多样性,提高整体预测精度。
搜索关键词: 一种 基于 残基 接触 多目标 优化 蛋白质 结构 预测 方法
【主权项】:
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