[发明专利]一种基于无参考基因组的群体进化分析方法在审
申请号: | 202010768331.5 | 申请日: | 2020-08-03 |
公开(公告)号: | CN112164424A | 公开(公告)日: | 2021-01-01 |
发明(设计)人: | 刘书云;张海焕;姜丽荣;孙子奎 | 申请(专利权)人: | 南京派森诺基因科技有限公司 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B30/00;G16B5/00 |
代理公司: | 上海天翔知识产权代理有限公司 31224 | 代理人: | 吕楚姗 |
地址: | 211800 江苏省南京市江北新区*** | 国省代码: | 江苏;32 |
权利要求书: | 暂无信息 | 说明书: | 暂无信息 |
摘要: | 本发明公开了一种基于2d‑RAD测序后无参考基因组的群体进化分析方法,通过将样本进行数据拆分后过滤聚类得到群体SNP,并基于样本分组和群体SNP信息进行群体遗传参数分析后构建系统发育树,确定最佳K值后利用所述R自写脚本,根据群体SNP信息和指定的群体信息来寻找两大Group之间的共有和特有SNP信息进行无参考基因组的群体进化分析。本发明的整个数据分析比较自动化,节省了人力成本,提高了分析效率,避免了可能的人为失误且分析的数据图表更加美观。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 参考 基因组 群体 进化 分析 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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