[发明专利]一种RNA序列中M5C位点的识别预测方法及系统在审
申请号: | 202010832292.0 | 申请日: | 2020-08-18 |
公开(公告)号: | CN111951889A | 公开(公告)日: | 2020-11-17 |
发明(设计)人: | 祝小雷;周巍巍;王红;刘宇峰;陈潇 | 申请(专利权)人: | 安徽农业大学 |
主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30;G06N20/10;G06K9/62;G06Q10/04 |
代理公司: | 合肥昊晟德专利代理事务所(普通合伙) 34153 | 代理人: | 王林 |
地址: | 230000 *** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | 本发明公开了一种RNA序列中M5C位点的识别预测方法及系统,属于M5C位点预测技术领域,包括以下步骤:S1:构建基准数据集;S2:利用特征表示RNA片段;S3:对特征进行优化选择;S4:构建预测模型;S5:利用模型进行预测。本发明构建了一个平衡的数据集Mat372,在此数据集的基础上,利用KNF、KSNPF和pseDNC三个特征对RNA片段进行编码,对特征进行优化选择后,利用SVM建立了M5C‑NSGAII预测模型,能够对RNA序列中的5‑甲基胞嘧啶(M5C)位点进行准确识别,值得被推广使用。 | ||
搜索关键词: | 一种 rna 序列 m5c 识别 预测 方法 系统 | ||
【主权项】:
暂无信息
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