[发明专利]基于层次聚类的蛋白质相互作用网络全局比对方法在审
| 申请号： | 202010838335.6 | 申请日： | 2020-08-19 |
| 公开（公告）号： | CN111916149A | 公开（公告）日： | 2020-11-10 |
| 发明（设计）人： | 陈璟;田盼盼 | 申请（专利权）人： | 江南大学 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00 |
| 代理公司： | 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙) 32257 | 代理人： | 许燕萍 |
| 地址： | 214122 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于层次聚类的蛋白质相互作用网络全局比对方法，包括：获取两个生物网络的数据及序列相似性文件，节点i、节点j分别属于两个网络，考虑节点本身以及邻居节点的拓扑特征计算节点对(i,j)间的拓扑相似性得分T(i,j)，根据序列相似性文件计算序列相似性得分B(i,j)，结合T(i,j)和B(i,j)计算节点相似性得分S(i,j)；采用层次聚类算法和组合优化算法筛选种子；计算种子的邻居节点的结构相似性得分score(i,j)，根据score(i,j)扩展种子得到扩展集；构建二分图比对剩余节点对，合并得到比对集。本发明更全面地计算T(i,j)，筛选种子并扩展、合并，提高比对结果的拓扑性能且覆盖范围更广；采用层次聚类算法和组合优化算法筛选种子，提升拓扑性能的同时保证生物性能，提高效率。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 层次 蛋白质 相互作用 网络 全局 方法 | ||
【主权项】：
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