[发明专利]一种基于全长小亚基核糖体RNA的反转录来分析微生物群落结构的方法有效
| 申请号： | 202010881408.X | 申请日： | 2020-08-27 |
| 公开（公告）号： | CN111996245B | 公开（公告）日： | 2022-12-16 |
| 发明（设计）人： | 全哲学;张汝毅;阎永伟 | 申请（专利权）人： | 复旦大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/04 |
| 代理公司： | 上海科盛知识产权代理有限公司 31225 | 代理人： | 刘燕武 |
| 地址： | 200433 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种基于全长小亚基核糖体RNA的反转录来分析微生物群落结构的方法，包括以下步骤：(1)快速提取样品中的总RNA；(2)在RNA的5’端加第一接头序列；(3)在能够覆盖真核和原核生物的通用反向引物的5’端加第二接头序列，用于反转录小亚基核糖体RNA；(4)在反转录产物中筛选核糖体SSU cDNA；(5)进行PCR扩增，获得双链全长核糖体SSU cDNA，对扩增产物进行测序，并提取出全长SSU rRNA序列；(6)根据所得全长SSU rRNA序列确定准确的分类信息，获得精细的微生物群落结构。与现有技术相比，本发明不使用“通用”正向引物，减少PCR过程产生的偏差，能够得到常规“通用”引物PCR扩增遗漏的微生物，并同时分析细菌、古生菌和真核微生物的整体群落结构等。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 全长 小亚基 核糖体 rna 转录 分析 微生物 群落 结构 方法 | ||
【主权项】：
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