[发明专利]基于三元组损失的蛋白质折叠识别方法有效
| 申请号： | 202010947616.5 | 申请日： | 2020-09-10 |
| 公开（公告）号： | CN112116949B | 公开（公告）日： | 2022-08-16 |
| 发明（设计）人： | 於东军;刘岩 | 申请（专利权）人： | 南京理工大学 |
| 主分类号： | G16B15/20 | 分类号： | G16B15/20;G06N3/04 |
| 代理公司： | 南京理工大学专利中心 32203 | 代理人： | 岑丹 |
| 地址： | 210094 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于三元组损失的蛋白质折叠识别方法，包括以下几个步骤：使用one‑hot编码对蛋白质进行编码，将编码后的蛋白质输入到SSA程序中，得到蛋白质残基与残基之间的接触图，把接触图作为输入数据，输入到预先训练好的深度学习框架中，网络的输出就为蛋白质特定于折叠识别的特征；把查询蛋白的特征与蛋白质数据库中已知蛋白质折叠类别的模板蛋白质相比较，将距离查询蛋白最近的模板蛋白质的折叠类别被分配给查询蛋白。本发明借鉴三元组损失的训练思想，使得同类之间的蛋白质结构距离更近，不同类之间的蛋白质结构更远，从而使得蛋白质的特征表达具有更强的鉴别力，使得识别效率更高。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 三元 损失 蛋白质 折叠 识别 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
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