[发明专利]一种基于生物序列的负序列模式的相似性分析方法、实现系统及介质有效

专利信息
申请号: 202011022788.8 申请日: 2020-09-25
公开(公告)号: CN112182497B 公开(公告)日: 2021-04-27
发明(设计)人: 董祥军;芦月 申请(专利权)人: 齐鲁工业大学
主分类号: G06F17/16 分类号: G06F17/16;G16B30/10;G16B45/00;G16B50/00
代理公司: 济南金迪知识产权代理有限公司 37219 代理人: 许德山
地址: 250353 山东*** 国省代码: 山东;37
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摘要: 发明涉及一种基于生物序列的负序列模式的相似性分析方法、实现系统及介质,包括:(1)数据预处理:将DNA序列中的字母用数字来表示;并分割成若干个块,得到的若干个块作为频繁模式挖掘的数据集;(2)频繁模式挖掘:使用f‑NSP算法来挖掘数据集;(3)对最大频繁正、负序列模式进行图形表示;把最大频繁正、负序列模式转化为数字序列;(4)DNA序列的相似性分析:求取不同DNA序列的相似度,选取相似度最小的对应的DNA序列为待研究的DNA序列。本发明可以有效地对负序列进行有效的表达和分析,并且通过选取不同的最大频繁模式组合,能够得到不同的分析结果,大大节省了计算机的内存和时间的消耗。
搜索关键词: 一种 基于 生物 序列 模式 相似性 分析 方法 实现 系统 介质
【主权项】:
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