[发明专利]一种基于迭代搜索策略的蛋白质溶剂可及性预测方法有效
| 申请号： | 202011030157.0 | 申请日： | 2020-09-27 |
| 公开（公告）号： | CN112216345B | 公开（公告）日： | 2021-12-17 |
| 发明（设计）人： | 胡俊;樊学强;董世建;白岩松;张贵军 | 申请（专利权）人： | 浙江工业大学 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G16B50/30 |
| 代理公司： | 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 | 代理人： | 王利强 |
| 地址： | 310014 浙江省*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 一种基于迭代搜索策略的蛋白质溶剂可及性预测方法，首先，根据输入的待测定溶剂可及性的蛋白质序列信息，使用HHBlits工具生成对应的多序列联配信息，进而生成对应的位置特异性频率矩阵，同时，对PDB数据库中每条蛋白质序列也进行上述操作；其次，计算输入的蛋白质序列的位置特异性频率矩阵和PDB数据库中每条蛋白质的位置特异性频率矩阵的相似度；然后，从PDB数据库中获取与输入蛋白质相似度最高的多条蛋白质序列及结构信息，并将其作为模板蛋白质；再次，使用DSSP工具计算每条模板蛋白质的溶剂可及性信息；最后，根据模板蛋白质的溶剂可及性信息，预测输入蛋白质序列的溶剂可及性。本发明计算代价低、预测精度高。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 搜索 策略 蛋白质 溶剂 预测 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
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