[发明专利]一种柑橘全基因组KASP标记库的构建方法及应用在审
申请号: | 202011104524.7 | 申请日: | 2020-10-15 |
公开(公告)号: | CN112289384A | 公开(公告)日: | 2021-01-29 |
发明(设计)人: | 邓秀新;宋谢天;王楠;叶俊丽;曹榛;张斯淇 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | G16B50/00 | 分类号: | G16B50/00;G16B50/30;G16B30/10;C12Q1/6895 |
代理公司: | 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 | 代理人: | 姚晓丽 |
地址: | 430070 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | 本发明提供一种柑橘全基因组KASP标记库的构建方法及应用,属于KASP标记库技术领域。所述柑橘KASP标记库的构建方法,包括如下步骤:导入群体父母本DNA样本以及杂交子代单株DNA样本;滤除样本中的偏分离位点;将过滤后的基因组VCF文件中的未知基因型数据进行基因型填充;对经填充的基因组VCF文件中的单碱基变异SNP数据进行过滤处理,得到最终基因组VCF文件;将最终基因组VCF文件导入KASP标记生成软件中,生成柑橘KASP标记库。本发明还公开了上述构建的柑橘KASP标记库的应用。本发明的KASP标记库可用于鉴定表型,具有高效、准确的优点。 | ||
搜索关键词: | 一种 柑橘 基因组 kasp 标记 构建 方法 应用 | ||
【主权项】:
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