[发明专利]一种柑橘全基因组KASP标记库的构建方法及应用在审

专利信息
申请号: 202011104524.7 申请日: 2020-10-15
公开(公告)号: CN112289384A 公开(公告)日: 2021-01-29
发明(设计)人: 邓秀新;宋谢天;王楠;叶俊丽;曹榛;张斯淇 申请(专利权)人: 华中农业大学
主分类号: G16B50/00 分类号: G16B50/00;G16B50/30;G16B30/10;C12Q1/6895
代理公司: 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 代理人: 姚晓丽
地址: 430070 湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明提供一种柑橘全基因组KASP标记库的构建方法及应用,属于KASP标记库技术领域。所述柑橘KASP标记库的构建方法,包括如下步骤:导入群体父母本DNA样本以及杂交子代单株DNA样本;滤除样本中的偏分离位点;将过滤后的基因组VCF文件中的未知基因型数据进行基因型填充;对经填充的基因组VCF文件中的单碱基变异SNP数据进行过滤处理,得到最终基因组VCF文件;将最终基因组VCF文件导入KASP标记生成软件中,生成柑橘KASP标记库。本发明还公开了上述构建的柑橘KASP标记库的应用。本发明的KASP标记库可用于鉴定表型,具有高效、准确的优点。
搜索关键词: 一种 柑橘 基因组 kasp 标记 构建 方法 应用
【主权项】:
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