[发明专利]一种为基因数据库确定最佳序列比对阈值的方法有效
| 申请号： | 202011117987.7 | 申请日： | 2020-10-19 |
| 公开（公告）号： | CN112365930B | 公开（公告）日： | 2022-06-10 |
| 发明（设计）人： | 刘思彤;潘珏君;陈倩 | 申请（专利权）人： | 北京大学 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B40/00;G16B50/00 |
| 代理公司： | 北京智绘未来专利代理事务所(普通合伙) 11689 | 代理人： | 郭红燕 |
| 地址： | 100871*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 一种为基因数据库确定最佳序列比对阈值的方法，包括：1)获取蛋白质序列；2)从蛋白质序列中移除被包括在基因数据库中的序列，创建假基因数据集；3)将基因数据库中的蛋白质序列划分子类，作为真基因数据集；4)合并假基因数据集与真基因数据集，针对任意一条蛋白质序列，模拟高通量测序所产生的特定长度的DNA序列，得到模拟数据集；5)进行序列比对，对比对阈值进行取值；6)判定序列比对结果，计算真阳性、错配、假阳性、假阴性、真阴性的数量；7)计算灵敏度、准确度和马修斯相关系数；8)以相似度为X轴，E值为Y轴，灵敏度、准确度或马修斯相关系数为Z轴，绘制三维曲面图；9)在三维曲面图确定基因数据库的最佳序列比对阈值。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基因 数据库 确定 最佳 序列 阈值 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
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