[发明专利]基于卷积神经网络预测蛋白和配体分子结合自由能的方法在审
| 申请号： | 202011147348.5 | 申请日： | 2020-10-23 |
| 公开（公告）号： | CN112185458A | 公开（公告）日： | 2021-01-05 |
| 发明（设计）人： | 王辉;马健;张佩宇;方磊;温书豪;赖力鹏 | 申请（专利权）人： | 深圳晶泰科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B15/20 | 分类号： | G16B15/20;G16B15/30;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司： | 深圳市科吉华烽知识产权事务所(普通合伙) 44248 | 代理人： | 胡吉科 |
| 地址： | 518000 广东省深圳市*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提供一种基于卷积神经网络预测蛋白和配体分子结合自由能的方法，包括以下几个步骤：（1）从PDB数据库，获取高质量的蛋白‑配体复合物晶体结构，以及从文献中收集小分子结构并进行3D构象准备；（2）对蛋白和小分子进行编码和描述符计算，将蛋白处理为3D图像；（3）用蛋白的3D图像作为输入，设计卷积神经网络的架构，包含输入层、隐藏层和输出层；（4）对预训练的模型进行了特征提取和微调，以应用在新数据集上；（5）待所有任务完成后，调用Pandas和Matplotlib数据分析库，直接在jupyter中绘制分析结果曲线。本发明实现了快速、精准的蛋白‑配体结合自由能计算，与实验值相比，误差较小，并可以将结果自动进行数据分析和可视化。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 卷积 神经网络 预测 蛋白 分子 结合 自由能 方法 | ||
【主权项】：
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