[发明专利]一种宏基因组测序数据自动化分析方法

摘要

本发明涉及生物信息领域，且公开了一种宏基因组测序数据自动化分析方法，包括原始下机数据过滤和质量控制、宿主基因组比对、肠道菌群物种注释和比对、肠道菌群代谢潜能分析、结果统计和输出等步骤。所有步骤使用Python脚本连接实现自动化分析，减少了繁琐的人工操作，降低了人工操作带来的各种错误。自动化分析方法的分析内容涵盖了大部分宏基因组分析的内容，可满足研究人员的分析需求，流程在运行时不仅会输出各步骤产生的中间结果，也会对相应的数据做统计分析及整理，输出相应的图表，方便使用者的浏览，同时流程运行日志记录所有流程相关信息，方便在流程运行出错时进行筛查。