[发明专利]无参考基因组序列的转录组分析方法及系统有效
申请号: | 202011255655.5 | 申请日: | 2020-11-11 |
公开(公告)号: | CN112397149B | 公开(公告)日: | 2023-06-09 |
发明(设计)人: | 田振阳;王苹 | 申请(专利权)人: | 天津现代创新中药科技有限公司 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B20/30;G16B25/10;G16B5/00 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 路秀丽 |
地址: | 300142 天津市西青*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | 本发明提供了一种无参考基因组序列的转录组分析方法及系统。该分析方法包括:获取待测样本的二代RNA有效测序数据和三代RNA有效测序数据;利用二代RNA有效测序数据对三代RNA有效测序数据进行校正;对三代校正后的有效数据进行去冗余获得unigene序列;根据已知数据库对unigene序列进行基因注释,得到参考转录组注释文件;将二代RNA有效测序数据与unigene序列进行序列比对,利用比对文件,对每个unigene序列上的reads数进行统计,获得每个基因的表达水平FPKM值。该分析方法整合了二代和三代测序技术的优势,解决了目前尚无利用三代测序数据进行对无参考基因组序列的转录组进行分析的问题。 | ||
搜索关键词: | 参考 基因组 序列 转录 组分 方法 系统 | ||
【主权项】:
暂无信息
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