[发明专利]一种小蛋白骨架设计方法及其应用有效

专利信息
申请号: 202011382858.0 申请日: 2020-12-01
公开(公告)号: CN112382336B 公开(公告)日: 2023-09-01
发明(设计)人: 王天元;吴炜坤;赖力鹏;温书豪;马健 申请(专利权)人: 北京晶泰科技有限公司
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00;G16B30/10;G16B30/20;G16B40/00;G16B50/00
代理公司: 深圳市科吉华烽知识产权事务所(普通合伙) 44248 代理人: 胡吉科
地址: 100083 北京市海淀区中*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供一种小蛋白骨架的设计方法及其应用,包括以下步骤,S1:创建专用的结构片段数据库;S2:生成小蛋白骨架数据库;S3:对小蛋白骨架进行氨基酸序列优化和设计;S4:采用与稳定性相关的指标对结构进行评价和过滤,不满足标准的结构将被移除过滤,最终形成计算预测上能够稳定折叠的小蛋白。本方法与现有方法最大的不同在于,文献报道设计的拓扑结构为HLHLHLHLH,而本发明设计的是更小的拓扑结构为HLHLH的蛋白,并且本发明根据HLHLH拓扑结构的专门定义了更加严格的过滤标准,改进了SEWING的采样方法,因此设计出来的蛋白稳定性和序列可设计性应当更高,并且计算过程中优质骨架生成的效率更高。
搜索关键词: 一种 蛋白 骨架 设计 方法 及其 应用
【主权项】:
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