[发明专利]基于遗传算法的生物网络比对方法在审
申请号: | 202011466845.1 | 申请日: | 2020-12-14 |
公开(公告)号: | CN112446492A | 公开(公告)日: | 2021-03-05 |
发明(设计)人: | 陈璟;陈悦 | 申请(专利权)人: | 江南大学 |
主分类号: | G06N3/12 | 分类号: | G06N3/12 |
代理公司: | 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙) 32257 | 代理人: | 杨慧林 |
地址: | 214122 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于遗传算法的生物网络比对方法,包括以下步骤:步骤1:读取源网络、目标网络数据文件及其序列相似性得分文件;步骤2:计算源网络、目标网络中节点的重要性得分,结合网络的拓扑相似性和序列相似性得分计算节点对相似性得分;步骤3:基于节点对相似性得分初始化种群;步骤4:计算种群中个体的适应度值;步骤5:选择、交叉产生下一代;步骤6:重复步骤4、步骤5直至目标函数收敛或迭代次数达到阈值。本发明计算了节点在网络中的拓扑重要性,结合节点对的序列信息,充分挖掘网络节点的拓扑和生物信息,使比对结果在拓扑特性和生物特性上保持均衡的高指标。 | ||
搜索关键词: | 基于 遗传 算法 生物 网络 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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