[发明专利]基于分治整合策略的成对蛋白质相互作用网络比对方法在审
申请号: | 202011528447.8 | 申请日: | 2020-12-22 |
公开(公告)号: | CN112669907A | 公开(公告)日: | 2021-04-16 |
发明(设计)人: | 陈璟;刘晓 | 申请(专利权)人: | 江南大学 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B40/00 |
代理公司: | 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙) 32257 | 代理人: | 郭磊 |
地址: | 214122 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于分治整合策略的成对蛋白质相互作用网络比对方法,包括:步骤1:读取源网络和目标网络及BLAST相似性文件;步骤2:采用基于结点和路径相结合的方法分别计算两个网络中结点的相似性得分,结合所述相似性得分分别对两个网络进行模块划分;步骤3:获取同源蛋白对,根据同源蛋白对和BLAST相似性分别计算来自不同网络模块间的相似性;根据相似性将来自不同网络的模块进行一对一匹配。本发明的有益效果:使用基于结点和基于路径的相似性计算方法,代替自相似性文件,解决了对自相似性文件的依赖问题。 | ||
搜索关键词: | 基于 分治 整合 策略 成对 蛋白质 相互作用 网络 方法 | ||
【主权项】:
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