[发明专利]一种用于宏基因组测序数据的微生物物种与功能组成分析方法在审

专利信息
申请号: 202011592565.5 申请日: 2020-12-29
公开(公告)号: CN112599198A 公开(公告)日: 2021-04-02
发明(设计)人: 李鸿毅;曲昊淼;寇文伯;薛正晟;孙子奎 申请(专利权)人: 上海派森诺生物科技股份有限公司
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G16B50/00
代理公司: 上海点威知识产权代理有限公司 31326 代理人: 胡志强
地址: 200030 上海市*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种用于宏基因组测序数据的微生物物种与功能组成分析方法,包括下列步骤:1)切除原始数据中的接头序列片段、低质量片段,滤除过短序列、含模糊碱基序列;2)使用上述获得的数据进行物种注释,3)对剔除非目物种后的序列进行拼接,4)对叠连群序列进行相似性聚类,5)使用blastn算法,6)预测非冗余的叠连群序列中的基因区域,7)将非冗余蛋白序列集与各类蛋白注释数据库进行比对,8)计算基因序列丰度,本发明满足了拼接产生的叠连群序列的进一步分析,避免了结果假阳性高,依赖于专用数据库的构建,适用面窄的问题;灵敏度高,提高了准确性。
搜索关键词: 一种 用于 宏基 序数 微生物 物种 功能 组成 分析 方法
【主权项】:
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