[发明专利]预测/验证激活剂对Sirtuin与烟酰胺腺嘌呤结合效果的影响

摘要

本发明公开了一种预测/验证多酚类化合物激活剂对Sirtuin与烟酰胺腺嘌呤(NAD+)结合效果影响的方法，利用一系列对复合体系的计算处理和副本交换分子动力学模拟，Sirtuin/NAD+复合物结构和Sirtuin/激活剂/NAD+复合物结构可实现全局优化并得到稳态构型。在此基础上对两种复合物体系进行结构稳定性比较、残基稳定性比较和NAD+与Sirtuin的结合能比较，预测/验证激活剂对NAD+与Sirtuin结合效果的影响。相比实验方法，本方法时间和人力成本更低，可帮助实验进行预筛选。相比传统计算方法，本方法提供了更准确的蛋白质单/双分子稳态构型，从而使稳定性和结合能的判断更准确，整体提高了激活剂预测/验证的正确率，提升效率。