[发明专利]一种细胞特异性基因组G-四链体的预测方法有效
| 申请号： | 202110030502.9 | 申请日： | 2021-01-11 |
| 公开（公告）号： | CN113160877B | 公开（公告）日： | 2022-11-25 |
| 发明（设计）人： | 孙啸;张卓凡;居胜红;杨婧;刘宏德 | 申请（专利权）人： | 东南大学 |
| 主分类号： | G16B15/30 | 分类号： | G16B15/30;G16B20/20 |
| 代理公司： | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人： | 丁静静 |
| 地址： | 211102 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种细胞特异性的G4‑DNA预测方法，属于基因技术领域。该方法包括以下步骤：(1)产生给定物种所有潜在的G4‑DNA序列集合；(2)收集该物种实验检测所获得的细胞特异性G4‑DNA数据；(3)计算对应细胞全基因组范围的染色质开放结构信号和甲基化分布信号；(4)建立G4‑DNA的细胞特异性染色质环境特征向量；(5)建立正负训练样本集合；(6)通过样本训练，建立细胞特异性的G4‑DNA预测分类器，其输入是潜在序列的特征向量，输出是正负样本分类结果。现有G4‑DNA预测方法只能识别体外形成的G4‑DNA或者具有体内活性的G4‑DNA，而本方法能够识别特定细胞中存在的G4‑DNA。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 细胞 特异性 基因组 四链体 预测 方法 | ||
【主权项】：
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