[发明专利]神经网络提取调控DNA组合模式的训练和可视化方法及系统有效

专利信息
申请号: 202110063192.0 申请日: 2021-01-18
公开(公告)号: CN112735514B 公开(公告)日: 2022-09-16
发明(设计)人: 汪小我;魏征 申请(专利权)人: 清华大学
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00;G16B30/00;G16B40/00;G16B50/00;G06N3/04;G06N3/08;G06N3/12
代理公司: 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 代理人: 李岩
地址: 10008*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明公开了一种神经网络提取调控DNA组合模式的训练和可视化方法及系统,该方法包括:获取具有特定功能的DNA序列和不具有特定功能的DNA序列;对两种DNA序列进行标注,并将具有特定功能的DNA序列和不具有特定功能的DNA序列使用独热编码表示;搭建卷积神经网络,将标注后的DNA序列的独热编码作为输入,对应DNA序列标注为卷积神经网络输出的拟合值,对卷积神经网络进行训练,以使卷积神经网络识别DNA序列;使用NeuronMotif算法将训练后的卷积神经网络解耦,获得基因调控元件组合模块,并使用调控元件语法树进行表示和存储。该方法提供了一种解耦卷积神经网络的通用神经网络解释算法NeuronMotif,以发掘和可视化卷积神经网络所识别的模式。
搜索关键词: 神经网络 提取 调控 dna 组合 模式 训练 可视化 方法 系统
【主权项】:
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