[发明专利]基于目标区域捕获测序的ctDNA甲基化水平预测装置及方法有效
| 申请号： | 202110072090.5 | 申请日： | 2021-01-20 |
| 公开（公告）号： | CN112397150B | 公开（公告）日： | 2021-04-20 |
| 发明（设计）人： | 韩天澄;宋小凤;于佳宁;洪媛媛;裴志华;陈维之;何骥;杜波 | 申请（专利权）人： | 臻和（北京）生物科技有限公司;无锡臻和生物科技股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B40/00;G16B50/00 |
| 代理公司： | 常州佰业腾飞专利代理事务所(普通合伙) 32231 | 代理人： | 顾翰林 |
| 地址： | 100191 北京市海淀*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种基于目标区域捕获测序的ctDNA甲基化水平预测装置及方法，装置中包括：FASTQ文件处理模块，用于获取待测ctDNA样本捕获测序的FASTQ文件，并处理得到过滤后的FASTQ文件；待测样本比对模块，用于将得到的FASTQ文件中的基因序列与参考基因组进行比对并去重，得到对应的Bam文件；reads水平过滤模块，用于根据预先设定的C‑T转化率对生成的Bam文件中的reads进行逐条过滤，得到过滤后的Bam文件；甲基化水平预测模块，用于根据目标区域Bed文件及预先设定的各reads中覆盖CpG位点的数量进一步对Bam文件进行过滤，并根据剩余reads对CpG位点的甲基化水平进行预测。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 目标 区域 捕获 ctdna 甲基化 水平 预测 装置 方法 | ||
【主权项】：
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