[发明专利]一种基于循环网络的蛋白质与蛋白质相互作用预测方法在审

专利信息
申请号: 202110086831.5 申请日: 2021-01-22
公开(公告)号: CN112837742A 公开(公告)日: 2021-05-25
发明(设计)人: 胡俊;樊学强;郑琳琳;董世建;白岩松;张贵军 申请(专利权)人: 浙江工业大学
主分类号: G16B15/30 分类号: G16B15/30;G16B40/00;G06N3/04;G06N3/08
代理公司: 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 代理人: 王利强
地址: 310014 浙江省*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 一种基于循环网络的蛋白质与蛋白质相互作用预测方法,首先,根据输入的待测定蛋白质‑蛋白质作用的蛋白质序列信息,生成蛋白质序列的残基组成特征、残基过渡特征、残基分布特征;其次,生成蛋白质序列的残基组成特征、残基过渡特征、残基分布特征;然后,生成蛋白质序列的残基组成特征、残基过渡特征、残基分布特征;再次,搭建循环神经网络框架,从PDB库中收集已有蛋白质‑蛋白质界面相互作用的蛋白质序列和标签,计算蛋白质序列的特征张量,与对应的标签组成数据集,使用循环神经网络框架在数据集上学习预测模型;最后,将待进行蛋白质‑蛋白质界面相互作用预测的特征向量输入模型中,得到界面作用预测结果。本发明计算代价低、预测精度高。
搜索关键词: 一种 基于 循环 网络 蛋白质 相互作用 预测 方法
【主权项】:
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