[发明专利]一种分析细胞命运转换关键转录因子的方法及系统有效

专利信息
申请号: 202110086884.7 申请日: 2021-01-22
公开(公告)号: CN112820353B 公开(公告)日: 2023-10-03
发明(设计)人: 覃静;胡耀华 申请(专利权)人: 中山大学;深圳大学
主分类号: G16B25/10 分类号: G16B25/10;G16B30/10;G16B5/00;C12Q1/6869
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 谭英强
地址: 510275 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开了一种分析细胞命运转换关键转录因子的方法及系统,方法包括对细胞进行转录组测定得到基因表达谱并进行比对,得到差异基因;对细胞进行扰动并进行转录组测定得到基因表达谱矩阵;从基因表达谱矩阵中提取转录因子表达谱生成第一矩阵;从基因表达谱矩阵中提取差异基因表达谱生成第二矩阵;根据转录因子结合位点信息生成第三矩阵;得到正则化模型并计算得到关键转录因子预测结果。本发明通过与目标细胞相关的转录因子信息、差异基因信息及转录因子结合位点信息构建正则化模型,并通过正则化模型对影响细胞命运转换的关键转录因子进行预测,相较于现有技术可以有效提高对关键转录因子的预测准确度。本发明可以广泛应用于生物技术领域。
搜索关键词: 一种 分析 细胞 命运 转换 关键 转录 因子 方法 系统
【主权项】:
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