[发明专利]一种基于循环神经网络的蛋白质二级结构预测方法在审

专利信息
申请号: 202110097155.1 申请日: 2021-01-25
公开(公告)号: CN112837741A 公开(公告)日: 2021-05-25
发明(设计)人: 胡俊;殷文杰;贾宁欣;曾文武;董明;张贵军 申请(专利权)人: 浙江工业大学
主分类号: G16B15/20 分类号: G16B15/20;G16B40/00
代理公司: 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 代理人: 王利强
地址: 310014 浙江省*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 一种基于循环神经网络的蛋白质二级结构预测方法,首先根据输入的待进行二级结构预测的蛋白质序列,使用独热编码方式对蛋白质序列进行编码,获取一个L×20的特征矩阵M1,使用PSI‑BLAST程序生成蛋白质位置特异性评分矩阵PSSM;然后,将M1和PSSM进行矩阵加法运算得到矩阵M2;其次,获取残基的特征向量;再次,搭建循环神经网络框架,通过从PDB数据库获取已知二级结构标签的蛋白质序列构建样本集,训练搭建的循环神经网络;最后,将待进行预测的蛋白质序列中残基的特征向量输入到训练的模型中,根据输出的概率值来预测蛋白质序列中残基的二级结构类别。本发明计算代价低、预测精确性高。
搜索关键词: 一种 基于 循环 神经网络 蛋白质 二级 结构 预测 方法
【主权项】:
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