[发明专利]一种基于流形学习和主曲线的单细胞轨迹推断方法在审
| 申请号： | 202110109386.X | 申请日： | 2021-01-27 |
| 公开（公告）号： | CN112768001A | 公开（公告）日： | 2021-05-07 |
| 发明（设计）人： | 卢新国;江开宝;何可人 | 申请（专利权）人： | 湖南大学 |
| 主分类号： | G16B20/20 | 分类号： | G16B20/20;G16B25/10 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 410082 湖南省*** | 国省代码： | 湖南;43 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明涉及生物信息学中的数据挖掘领域，具体涉及一种基于流形学习和主曲线的单细胞轨迹推断方法。其发明内容主要包括：(1)收集已知单细胞RNA‑seq相关数据；(2)进行特征提取，选择可变基因作为特征；(3)进行数据降维，缓解维度诅咒；(4)局部定义主曲线，提出了一个初始化过程；(5)应用分段子空间约束的均值移动算法建立最终主曲线模型；(6)对模型进行伪时间分析，建立直树拓扑图；(7)在直树拓扑图上进行差异表达基因检测。本发明提供了一种单细胞轨迹推断方法，以重建和捕获有机体内的谱系关系，能够检测差异表达基因，获取到基于对细胞分化的影响。本发明的方法可行且有效，对于研究组织或有机体内谱系关系和实现精准医疗具有重要意义。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 流形 学习 曲线 单细胞 轨迹 推断 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于湖南大学，未经湖南大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/202110109386.X/，转载请声明来源钻瓜专利网。
