[发明专利]基于信息熵筛选单细胞数据敏感性基因的方法在审

专利信息
申请号: 202110113321.2 申请日: 2021-01-27
公开(公告)号: CN114822686A 公开(公告)日: 2022-07-29
发明(设计)人: 陈泽川;郝沛;张晓明 申请(专利权)人: 上海大学;中国科学院上海巴斯德研究所
主分类号: G16B20/20 分类号: G16B20/20;G16B40/30;G06K9/62
代理公司: 上海一平知识产权代理有限公司 31266 代理人: 马莉华;徐迅
地址: 200444*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明提供了一种基于信息熵筛选单细胞数据敏感性基因的方法及基于其的单细胞聚类分析方法和系统。具体地,包括:S1.接收单细胞测序数据的初次无监督聚类分析结果;S2.1根据所述无监督聚类分析结果,计算每个簇中各基因的变异系数,并将所述变异系数在簇内排名;S2.2保留在一自定义比例的簇内均具有高变异系数的基因;S2.3计算所述具有高变异系数的基因在每个簇中的平均表达量x,用于计算信息熵H(x);S2.4将某一基因的信息熵H(x)与一自定义的信息熵阈值X比较,从而得到敏感性基因筛选结果。使用本发明的方法可筛选敏感基因,从而进行单细胞测序数据的降噪,进而优化无监督聚类分析结果。
搜索关键词: 基于 信息 筛选 单细胞 数据 敏感性 基因 方法
【主权项】:
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