[发明专利]一种基于质谱代谢组学的通路分析建模方法有效
申请号: | 202110277077.3 | 申请日: | 2021-03-15 |
公开(公告)号: | CN113049664B | 公开(公告)日: | 2022-11-22 |
发明(设计)人: | 邓伶莉;马磊;韩碧荣 | 申请(专利权)人: | 东华理工大学 |
主分类号: | G01N27/62 | 分类号: | G01N27/62;G01N30/72;G01N30/86;G16B40/00 |
代理公司: | 厦门市首创君合专利事务所有限公司 35204 | 代理人: | 张松亭;王婷婷 |
地址: | 330000 江西*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | 本发明提供一种质谱代谢组学的代谢通路分析建模方法,包括如下步骤:S1:采集正常生物和患病生物的生物样本,对采集样本得到的质谱转化成mzML文件,对质谱文件进行中心化、去噪以及对齐处理,得到样本的代谢物的二维数据矩阵;S2:对样本的代谢物的二维数据矩阵以及样本类别矢量矩阵,做中心化和Unite Variance归一化处理;S3:获取代谢物‑通路映射关系,并通路权重系数进行优化;S4:进行通路排序,调整惩罚因子并确定通路被选频率,利用通路的被选频率对通路进行排序;本发明提供的方法,通过将代谢物分组为相互之间有重叠的通路,将偏最小二乘法和Group Lasso相结合建立回归模型,并引入通路权重系数和惩罚因子,实现基于“分组稀疏”的多元回归。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 代谢 通路 分析 建模 方法 | ||
【主权项】:
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