[发明专利]基于snakemake语言快速批量可自动邮件反馈结果的高通量测序质控分析方法有效

专利信息
申请号: 202110338467.7 申请日: 2021-03-30
公开(公告)号: CN112967756B 公开(公告)日: 2022-07-26
发明(设计)人: 张建明;顾胤聪;肖云平;史贤俊;刘钰钏;林博 申请(专利权)人: 上海欧易生物医学科技有限公司
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G16B40/00;G16B45/00;G16B50/00;G06Q10/10
代理公司: 上海德禾翰通律师事务所 31319 代理人: 夏思秋
地址: 201114 上海市闵行*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种基于snakemake语言快速批量可自动邮件反馈结果的高通量测序质控分析方法,所述方法具体包括如下步骤:文件准备;多样本并行fastp质控过滤;单样本fastp运行监控;所有样本fastp质控结果汇总;质控结果汇总邮件反馈;多样本并行fastqc检测;所有样本结果进行整合;分析方法图绘制。本发明所述分析方法能够对样本进行批量处理,获得的结果全面,并能够自动整理所有分析结果,进行统计汇总可视化,同时所有操作步骤可溯源,方便错误查询。
搜索关键词: 基于 snakemake 语言 快速 批量 自动 邮件 反馈 结果 通量 测序质控 分析 方法
【主权项】:
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