[发明专利]一种批量合并eQTL分析结果中存在连锁不平衡SNP的方法在审
申请号: | 202110346625.3 | 申请日: | 2021-03-31 |
公开(公告)号: | CN113066530A | 公开(公告)日: | 2021-07-02 |
发明(设计)人: | 孙程明;张洁夫;胡茂龙;付三雄;郭月;陈松;彭琦;王晓东;陈峰;张维 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | G16B20/20 | 分类号: | G16B20/20;G16B50/00 |
代理公司: | 北京德崇智捷知识产权代理有限公司 11467 | 代理人: | 王斌 |
地址: | 210014 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了一种批量合并eQTL分析结果中存在连锁不平衡SNP的方法。本发明所提供的合并eQTL分析结果中存在连锁不平衡SNP的方法基于SNP与靶基因的位置信息将其分为顺式和反式SNP,基于SNP位置信息合并相邻的SNP为一个SNP cluster,基于SNP cluster间的连锁不平衡程度进一步合并结果。本发明的脚本由python3语言写成,速度快,灵活性高,可靠性强,实现了批量化、自动化和流程化计算。本发明将在eQTL分析结果的简化上发挥重要作用。 | ||
搜索关键词: | 一种 批量 合并 eqtl 分析 结果 存在 连锁 不平衡 snp 方法 | ||
【主权项】:
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