[发明专利]一种批量合并eQTL分析结果中存在连锁不平衡SNP的方法在审

专利信息
申请号: 202110346625.3 申请日: 2021-03-31
公开(公告)号: CN113066530A 公开(公告)日: 2021-07-02
发明(设计)人: 孙程明;张洁夫;胡茂龙;付三雄;郭月;陈松;彭琦;王晓东;陈峰;张维 申请(专利权)人: 江苏省农业科学院
主分类号: G16B20/20 分类号: G16B20/20;G16B50/00
代理公司: 北京德崇智捷知识产权代理有限公司 11467 代理人: 王斌
地址: 210014 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种批量合并eQTL分析结果中存在连锁不平衡SNP的方法。本发明所提供的合并eQTL分析结果中存在连锁不平衡SNP的方法基于SNP与靶基因的位置信息将其分为顺式和反式SNP,基于SNP位置信息合并相邻的SNP为一个SNP cluster,基于SNP cluster间的连锁不平衡程度进一步合并结果。本发明的脚本由python3语言写成,速度快,灵活性高,可靠性强,实现了批量化、自动化和流程化计算。本发明将在eQTL分析结果的简化上发挥重要作用。
搜索关键词: 一种 批量 合并 eqtl 分析 结果 存在 连锁 不平衡 snp 方法
【主权项】:
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