[发明专利]鉴定热带和温带玉米自交系全基因组染色质结构差异方法在审
| 申请号： | 202110357033.1 | 申请日： | 2021-04-01 |
| 公开（公告）号： | CN112941158A | 公开（公告）日： | 2021-06-11 |
| 发明（设计）人： | 田磊 | 申请（专利权）人： | 田磊 |
| 主分类号： | C12Q1/6858 | 分类号： | C12Q1/6858 |
| 代理公司： | 西安汇恩知识产权代理事务所(普通合伙) 61244 | 代理人： | 张伟花 |
| 地址： | 450002 河南省郑州*** | 国省代码： | 河南;41 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种鉴定热带和温带玉米自交系全基因组染色质结构差异方法，该方法为：提取热带自交系CML288和温带自交系D132的组织细胞，利用Hi‑C，经染色体空间三维模型重建、生物信息学分析，在两种自交系的全基因组水平的染色质中鉴定了A组分和B组分及拓扑结构域；构建Hi‑C文库，鉴定得到了A和B两种组分及两自交系的拓扑结构域；结合转录组学、H3K4me3组蛋白ChIP‑seq数据分析，鉴定了与组蛋白修饰和转录水平变化相关的染色质互作对。本发明可鉴定在热带自交系CML288和温带自交系D132组织间全基因组水平染色质的变化模式，8.76％的组分和64％的拓扑结构域在两种自交系发生变化，783对增加的染色质互作和1330对强度降低的互作在两个自交系中被鉴定。 | ||
| 搜索关键词： | 鉴定 热带 温带 玉米 自交系 基因组 染色质 结构 差异 方法 | ||
【主权项】：
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