[发明专利]一种基于外显子区域插入的数据压缩方法有效
| 申请号： | 202110388432.4 | 申请日： | 2021-04-12 |
| 公开（公告）号： | CN112863600B | 公开（公告）日： | 2022-05-24 |
| 发明（设计）人： | 张云翔;李杨;刘博;王亚东 | 申请（专利权）人： | 哈尔滨工业大学 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G16B30/20 |
| 代理公司： | 哈尔滨华夏松花江知识产权代理有限公司 23213 | 代理人： | 岳昕 |
| 地址： | 150001 黑龙*** | 国省代码： | 黑龙江;23 |
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| 摘要： | 一种基于外显子区域插入的数据压缩方法，涉及数据压缩领域。本发明是为了解决现有的数据压缩方法压缩时运行速度慢、压缩适应范围窄、压缩存储量消耗大的问题。本发明包括：对测序短读DNA数据进行预处理获取外显子数据集合；对外显子数据集合进行质控获取异常值并将异常值存储在哈希表中；将哈希表中的异常值进行有序存放；使用霍夫曼编码对存放在哈希表中的异常值中的碱基进行压缩存储；利用LYZip局部解压缩方法判断此时累积插入序列深度是否已经达到30X，如果大于30X则表明无法进行插入压缩；如果小于30X，并且累加上新加入的插入序列仍然小于30X，则重复压缩步骤。本发明用于对数据的压缩。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 外显子 区域 插入 数据压缩 方法 | ||
【主权项】：
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