[发明专利]一种基于深度学习的蛋白质质谱数据的分析方法及系统在审

专利信息
申请号: 202110425032.6 申请日: 2021-04-20
公开(公告)号: CN113362899A 公开(公告)日: 2021-09-07
发明(设计)人: 何情祖;郭欢;帅建伟;韩家淮 申请(专利权)人: 厦门大学
主分类号: G16B40/10 分类号: G16B40/10;G06N3/04;G06N3/067
代理公司: 厦门市首创君合专利事务所有限公司 35204 代理人: 张松亭;李艾华
地址: 361000 *** 国省代码: 福建;35
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摘要: 发明公开了一种基于深度学习的蛋白质质谱数据的分析方法及系统,包括:获取样品的DIA蛋白质数据;基于DIA蛋白质数据,沿驻留时间维度以特定步幅移动的滑块为最小处理单元,删除滑块中的低信噪比的背景离子,确定候选母离子和候选子离子;将候选子离子的提取色谱输入变分自编码器编码神经网络后,嵌入到欧氏空间中,然后用k均值分类算法将其划分为k类;基于蛋白质数据库将每个碎片子离子簇与相应的母离子结合,生成母离子‑碎片子离子对;通过计算与理论谱相匹配的碎片子离子间的相似度,再次判断这些母离子‑碎片子离子对,将相似度超过预设阈值的母离子‑碎片子离子对作为伪串联谱存储。本发明能够提高鉴定到的肽段和蛋白质的数量。
搜索关键词: 一种 基于 深度 学习 蛋白质 数据 分析 方法 系统
【主权项】:
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