[发明专利]一种基于深度学习的蛋白质质谱数据的分析方法及系统在审
申请号: | 202110425032.6 | 申请日: | 2021-04-20 |
公开(公告)号: | CN113362899A | 公开(公告)日: | 2021-09-07 |
发明(设计)人: | 何情祖;郭欢;帅建伟;韩家淮 | 申请(专利权)人: | 厦门大学 |
主分类号: | G16B40/10 | 分类号: | G16B40/10;G06N3/04;G06N3/067 |
代理公司: | 厦门市首创君合专利事务所有限公司 35204 | 代理人: | 张松亭;李艾华 |
地址: | 361000 *** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于深度学习的蛋白质质谱数据的分析方法及系统,包括:获取样品的DIA蛋白质数据;基于DIA蛋白质数据,沿驻留时间维度以特定步幅移动的滑块为最小处理单元,删除滑块中的低信噪比的背景离子,确定候选母离子和候选子离子;将候选子离子的提取色谱输入变分自编码器编码神经网络后,嵌入到欧氏空间中,然后用k均值分类算法将其划分为k类;基于蛋白质数据库将每个碎片子离子簇与相应的母离子结合,生成母离子‑碎片子离子对;通过计算与理论谱相匹配的碎片子离子间的相似度,再次判断这些母离子‑碎片子离子对,将相似度超过预设阈值的母离子‑碎片子离子对作为伪串联谱存储。本发明能够提高鉴定到的肽段和蛋白质的数量。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 深度 学习 蛋白质 数据 分析 方法 系统 | ||
【主权项】:
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