[发明专利]结合轮廓系数和RJMCMC算法的肿瘤基因点突变的特征提取方法有效

专利信息
申请号: 202110438217.0 申请日: 2021-04-22
公开(公告)号: CN113035275B 公开(公告)日: 2023-08-15
发明(设计)人: 李振彰;罗文;钟祺楠;翁剑波;黄亮雄;陆海威 申请(专利权)人: 广东技术师范大学
主分类号: G16B20/50 分类号: G16B20/50;G06F16/36;G06F16/26;G06F16/28;G06F17/18
代理公司: 东莞市神州众达专利商标事务所(普通合伙) 44251 代理人: 周松强
地址: 510000 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明提供结合轮廓系数和RJMCMC算法的肿瘤基因点突变的特征提取方法,涉及肿瘤基因特征提取技术领域。该结合轮廓系数和RJMCMC算法的肿瘤基因点突变的特征提取方法,包括以下步骤:S1、数据集获取:突变数据集突变类型包含Somatic SNV和Somatic INDEL,对Somatic SNV和Somatic INDEL进行整体统计使用MuTect软件。该结合轮廓系数和RJMCMC算法的肿瘤基因点突变的特征提取方法,实现注释文件的输入模式,方便使用,节约前期数据处理时间,提高效率,突变频谱3D可视化展示,让研究者可以从空间视觉上直观的看到每个类型的突变情况,增强类型的比较效果展示,创新性结合轮廓系数,进行构建了RJMCMCNMF的模型与算法实现,以及完成代码软件装置设计,实现特征图谱与基因关联获取的软件装置。
搜索关键词: 结合 轮廓 系数 rjmcmc 算法 肿瘤 基因 突变 特征 提取 方法
【主权项】:
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