[发明专利]一种基于二代测序技术的consensus序列统计分析、可视化方法在审
| 申请号： | 202110456786.8 | 申请日： | 2021-04-26 |
| 公开（公告）号： | CN113178231A | 公开（公告）日： | 2021-07-27 |
| 发明（设计）人： | 司昊睿;周鹏 | 申请（专利权）人： | 中国科学院武汉病毒研究所 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B45/00 |
| 代理公司： | 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 | 代理人： | 冯子玲 |
| 地址： | 430000 湖北省武*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于二代测序技术的consensus序列统计分析、可视化方法，包括如下步骤：S1、获取二代测序数据中的consensus序列；S2、对所述consensus序列进行文件序列数的统计，之后提取每条序列中每个位置的碱基并进行分析判断，找到每条序列中gaps和/或简并碱基；S3、对每条序列中所述gaps和/或简并碱基的类型、个数和位置进行统计，并获取每条序列的长度；S4、分别计算所述每条序列的序列覆盖度和所述gaps和/或简并碱基位置的标准差，输出结果，完成数据统计分析；通过对consensus序列中的gaps及简并碱基的位置、数量、大小和分散程度进行自动化统计分析，确定每条序列中的gaps及简并碱基的具体信息，从而能更高效的剔除这些gaps和简并碱基的片段，完成整个基因组的测序工作。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 二代 技术 consensus 序列 统计分析 可视化 方法 | ||
【主权项】：
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