[发明专利]基于肿瘤浸润性免疫细胞筛选肺腺癌的潜在预后生物标志物的方法在审
| 申请号： | 202110467905.X | 申请日： | 2021-04-28 |
| 公开（公告）号： | CN113140258A | 公开（公告）日： | 2021-07-20 |
| 发明（设计）人： | 陈湫扬;孔薇 | 申请（专利权）人： | 上海海事大学 |
| 主分类号： | G16B35/20 | 分类号： | G16B35/20;G16B40/00;G16B50/00 |
| 代理公司： | 上海元好知识产权代理有限公司 31323 | 代理人： | 贾慧琴;包姝晴 |
| 地址： | 201306 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于肿瘤浸润性免疫细胞筛选肺腺癌的潜在预后生物标志物的方法，包括：S1：对正常人与肺腺癌患者肺部细胞的转录本数据进行数据处理，筛选出差异表达基因；S2：使用EPIC计算肺腺癌组织中免疫细胞浸润的丰度，得到预后相关免疫细胞类型；根据预后相关免疫细胞类型，筛选出与预后相关免疫细胞类型相关的差异基因；S3：使用WGCNA对步骤S2得到的与预后相关免疫细胞类型相关的差异基因进行聚类分析，将其分为若干个聚类模块；S4：对包含基因最多且聚类效果最好的聚类模块进行蛋白质互作分析，筛选3‑6个肺腺癌候选基因；S5：对步骤S4得到的肺腺癌候选基因进行生存分析，得到肺腺癌潜在预后生物标志物。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 肿瘤 浸润 免疫 细胞 筛选 腺癌 潜在 预后 生物 标志 方法 | ||
【主权项】：
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