[发明专利]一种基于深度嵌入卷积神经网络的模体挖掘方法在审
申请号: | 202110509307.4 | 申请日: | 2021-05-11 |
公开(公告)号: | CN113096732A | 公开(公告)日: | 2021-07-09 |
发明(设计)人: | 黄德双;张寅东 | 申请(专利权)人: | 同济大学 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;G06N3/08;G06N3/04 |
代理公司: | 北京东方盛凡知识产权代理事务所(普通合伙) 11562 | 代理人: | 张雪 |
地址: | 200092 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明涉及一种基于深度嵌入卷积神经网络的模体挖掘方法,包括:S1、构建深度嵌入卷积神经网络eDeepCNN模型;S2、对DNA序列进行K‑mer编码,利用嵌入向量作为所述模型中K‑mer的输入表示,作为所述模型的数据集进行训练,并进行特征提取和绑定预测;S3、将所述深度嵌入卷积神经网络eDeepCNN模型与浅层网络对比,用于验证所述深度嵌入卷积神经网络eDeepCNN模型的优越性。本发明中,K‑mer编码显式建模了DNA序列中邻近核苷酸的依赖关系,隐含了DNA序列的形状信息,高维嵌入向量则可以充分表征K‑mer所包含的潜在信息。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 深度 嵌入 卷积 神经网络 挖掘 方法 | ||
【主权项】:
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